El Protectorado de Fundaciones es el órgano administrativo encargado de garantizar el ejercicio del derecho de fundación, reconocido por la Constitución española, y de asegurar que el funcionamiento de las fundaciones se ajusta a la normativa vigente. Las competencias del Protectorado de Fundaciones corresponden al titular de la Secretaría General Técnica.
El ámbito territorial a que se extiende la actividad del Protectorado es la Comunidad de Madrid.
Las fundaciones que dependen del Protectorado de Fundaciones de la Consejería de Sanidad tienen una vocación eminentemente sanitaria, y sus actividades principales se centran en áreas relacionadas con la promoción de la salud, y la prevención y el tratamiento de la enfermedad: investigación científica, clínica y médica; desarrollo de proyectos sobre sectores poblacionales afectados por dolencias o enfermedades; y realización de tareas de integración de quienes padecen enfermedades o adicciones, entre otras.