El conjunto montañoso de la Sierra de Guadarrama es muy rico en valores naturales, lo que lo hace merecedor de protección especial. Esa riqueza acumulada es expresión de un sistema de conjunto, diverso, compuesto e interrelacionado, y de su asociación a una unidad geográfica amplia, definida y modulada por el relieve, por su posición interior peninsular y por los restantes factores y características analizados.

El ámbito de ordenación incluye el macizo de Peñalara que además de conformar el área culminante de la Sierra de Guadarrama, el pico de Peñalara es el más alto de la Comunidad de Madrid con 2.428 m, constituye un extraordinario conjunto geomorfológico de origen glaciar que ofrece grandes valores de interés científico, cultural, pedagógico y recreativo y alberga humedales y charcas de alta montaña.  Además, incluye otro cordel montañoso, la Cuerda Larga, el Puerto de Navacerrada, la Sierra de la Morcuera, de menor altura que la anterior, el Puerto de Canencia, etc. Otras sierras y cumbres de interés son Siete Picos, que discurre entre el Puerto de Navacerrada y el Puerto de La Fuenfría, Sierra de los Porrones, Peña del Oso (2.196 m), Montón de Trigo (2.195 m), y el enclave único de La Pedriza, con litología dominante granítica, por donde discurre por fuertes pendientes como eje articulador el río Manzanares, que nace en el Ventisquero de la Condesa.

En el ámbito de ordenación se encuentran: Matorrales supraforestales, pastizales de alta montaña, estepas leñosas de altura y cascajares, pinares, sabinares y enebrales, robledales, hayedos y abedulares, quejigares y melojares, encinares, carrascales, alcornocales y acebuchales, cursos de agua y bosques de ribera, humedales y lagunas de alta montaña, sistemas naturales singulares de origen glaciar y periglaciar, formas de relieve y elementos geológicos singulares de montaña y alta montaña.

El ámbito de ordenación cuenta con una riqueza y diversidad importante en relación con la flora, la fauna y los hábitats naturales. Entre las especies más simbólicas, hay que citar: mariposa isabelina (Graellsia isabelae), águila imperial ibérica (Aquila adalberti), buitre negro (Aegypius monachus), cigüeña negra (Ciconia nigra), rana patilarga (Rana iberica), sapillo pintojo (Discoglossus galganoi) y lagartija carpetana (Iberolacerta cyreni).

Al mismo tiempo, la Sierra de Guadarrama es también un testimonio y una imagen cultural, consideración que debe ocupar un lugar destacado a la hora de configurar su ordenación. La distribución actual de los usos del suelo resulta de la conjunción entre el modelo tradicional de ocupación del territorio y las dinámicas socioeconómicas recientes. La dominante espacial en el ámbito de ordenación la definen los usos de los recursos naturales: el monte, el matorral y el roquedo.

Los paisajes de la Sierra de Guadarrama constituyen, un valioso patrimonio derivado de los notables componentes naturales de la montaña y de su interacción con transformaciones y aportaciones históricas y actuales, así como de imágenes e interpretaciones culturales. Los paisajes permiten definir unidades con concentración y diversificación de caracteres, por lo que su cartografía se ha utilizado como punto de partida del mosaico de la zonificación del Plan de Ordenación.