El Tercer Plan de Protección y Bienestar Animal de la Comunidad de Madrid mantiene una continuidad en cuanto a los objetivos básicos que se definieron en los anteriores Planes, es decir la educación en la tenencia responsable de animales de compañía para la disminución del abandono y el maltrato, el aumento de las adopciones y la mejora de las condiciones de los establecimientos de animales de compañía, pero con la adición de nuevas acciones para conseguir estos objetivos. Además incluye otros nuevos objetivos más centrados en el bienestar de animales de producción, experimentación y parques zoológicos, dados los avances en la normativa relativa a estos animales, tanto a nivel nacional como comunitario.  El tercer Plan se articula por tanto en torno a seis objetivos generales:

• Fomentar la tenencia responsable con el fin de disminuir los abandonos y los maltratos
• Aumentar las adopciones en los centros de acogida
• Mejorar las condiciones de los establecimientos que alojan animales de compañía
• Mejorar el bienestar de los animales de producción
• Mejorar el bienestar de los animales de experimentación
• Mejorar el bienestar de los animales de los parques zoológicos